1846 के बेयर फ्लैग विद्रोह में, जो मैक्सिकन-अमेरिकी युद्ध के दौरान हुआ था, जो तब कैलिफोर्निया के मैक्सिकन शासित क्षेत्र में अमेरिकी बसने वालों ने स्वतंत्रता की घोषणा की थी और मूल भालू ध्वज (14 जून, 1846) को फहराया था। अगले महीने अमेरिकी नौसैनिक बलों ने क्षेत्र का नियंत्रण जब्त कर लिया और कैलिफोर्निया गणराज्य के झंडे को स्टार्स और स्ट्राइप्स द्वारा बदल दिया गया।
भालू ध्वज की स्मृति संरक्षित थी, हालांकि मूल उदाहरण खो गए थे या नष्ट हो गए थे, और 1911 में कैलिफोर्निया विधायिका ने इसे आधिकारिक राज्य ध्वज के रूप में मान्यता दी थी। झंडे पर केंद्रीय प्रतीक के रूप में दिखाया गया कैलिफोर्निया ग्रिजली भालू, अब विलुप्त हो गया है। हवाई और टेक्सास के लोगों की तरह कैलिफोर्निया का झंडा इस मायने में असामान्य है कि इसमें पूर्व स्वतंत्र देश द्वारा इस्तेमाल किया गया डिज़ाइन है।
